Anos depois do final do primeiro filme a acção de Tropa de Elite 2 decorre num momento em que o agora Coronel Nascimento é nomeado para um cargo de cargo de importância dentro do serviço de informação da Secretaria de Segurança Pública do Rio de Janeiro. Nos meandros da política ele percebe que é aí que reside o principal problema, e não já dentro da favela