Não se pode dizer que aos 12 anos a vida sorrisse a Jonathan. Abandonado à porta de um orfanato quando era ainda bébé, foi adoptado por um piloto que passava mais tempo no ar do que em casa, o que faz com que ande de internato em internato. Devido à sua rebeldia, fora já expulso de seis e agora confronta-se com a sua última oportunidade: acaba por ser admitido na Escola St. Thomas de Leipzig, berço de um célebre coro infantil. De repente, a sua vida dá uma volta de 180 graus. Conhece novos amigos, começa a ter aproveitamento nas aulas e descobre que há adultos compreensivos e carinhosos, como o professor Justus, que, apesar de um espírito humanista e afável, oculta um segredo terrível que o marcou para toda a vida. Além do mais, o Natal aproxima-se e todos os alunos do colégio se envolvem na preparação de uma obra de teatro musicado, “A Aula Voadora”.