Michael Clayton é uma espécie de "polivalente" numa das maiores sociedades de advogados de Nova Iorque. Mandatado pelo co-fundador da firma, Marty Bach, Clayton encarrega-se dos trabalhos sujos da Kenner, Bach & Ledeen. Clayton limpa a "porcaria" que os clientes fazem, lidando com tudo desde atropelamentos e fuga, a histórias pouco abonatórias nos media, até mulheres que roubam lojas e políticos corruptos. Embora esgotado e descontente com o seu trabalho, Clayton está inextrincavelmente ligado à firma. Na empresa agro-química U/North, o lugar da responsável de consultadoria, Karen Crowder, está dependente do acordo no processo que a Kenner, Bach & Ledeen está a conduzir e que aparenta encaminhar-se para uma um brilhante desfecho. Quando o advogado de topo da empresa, o brilhante Arthur Edens, tem um aparente esgotamento e tenta sabotar todas as provas do caso, Marty Bach envia Michael Clayton para resolver este desastre sem precedentes e, ao fazê-lo, Clayton dá consigo cara a cara com a realidade da pessoa em que se transformou.
